一個音樂劇版本的查爾斯·狄更斯的《圣誕頌歌》，一個吝嗇的厭世者被帶上了一個神奇的旅程。

 由于兩年前揭發同僚貪污，臺北警官黃火土（梁家輝）被上級報復調入冷門的外事組工作，利益也曾連帶受損的新同事對他怒言相向，加上妻子清芳（劉若英）受不了他長期不回家要求離婚，黃火土感覺他的世界正在逐漸四分五裂。就在此時，三宗受害者的身份并無關聯的震驚了臺灣社會的離奇命案發生，法醫（楊貴媚）驗尸發現他們都是因中一種神秘的黑霉菌產生幻覺而死，因為缺乏此方面的人才，當局從美國請來此種案例的偵辦專家凱文萊特（David Morse）協助破案，黃火土重被任用。隨著一樁令所有人都目瞪口呆的事實的被發現，一場圍繞政治利益與民眾利益的斗爭也在黃火土和辦案伙伴李豐博（戴立忍）及整個警察隊伍之間展開。

　　故事發生在繁華的大都市東京，十四歲的少女阿綠（中村里砂 飾）失去了唯一的親人，孤苦無依的她在誤打誤撞之中走進了名為“赤貓座”的巡回馬戲團中，就此拉開了悲慘人生的序幕。無處可去的阿綠在馬戲團中受盡了眾人的凌辱和折磨，淪為奴隸和傭人，日子過得苦不堪言，每一天都是地獄般的寫照 。　　就在阿綠快要絕望之時，侏儒魔術師出現在了馬戲團中，出現在了她的眼前。侏儒魔術師的出現讓快要倒閉的馬戲團重現生機，他亦成為了馬戲團中最重要的成員。與此同時，阿綠在魔術師的身上找到了久違的溫暖和感情，兩人決定結婚，雙雙逃離這充滿了痛苦的魔窟。

　　三年前的 8 月 31 日，突如其來的“侵略者”，—艘巨大的“母艦”降落至東京上空，世界似乎迎來了終結……在那之后，絕望融入了日常生活，巨大的圓盤飄浮在上空的世界持續到現在。小山門出、中川凰蘭兩個高中少女，在這個走向終結的世界中，揮灑著自己的青春時代。