2008年1月の放送終了後も根強い人気を誇る「仮面ライダー電王」の最後の戦いを描く劇場版第3弾。世間で噂の幽霊列車について調査を開始したモモタロスたちの前に、“仮面ライダー幽汽”が立ちはだかる。なんとその正體は、誘拐された電王?良太郎だった。モモタロスや新たに電王となった幸太郎らは、良太郎の言葉を手がかりにデンライナーで300年前へと向かう。新電王?幸太郎を演じるのは「アクエリアンエイジ　劇場版」の桜田通。

　　經過長時間的休整，治療眼傷的瀨文焚流（加瀨亮 飾）終于隨著當麻（戶田惠梨香 飾）重返闊別已久的未詳，只是此時來自公安部公安五課的市柳（でんでん 飾）和吉川（北村一輝 飾）握得實權，令瀨文等人頗為氣悶。與此同時，在市井算命的覺被一掌握瞬間移動能力的黑衣男子射殺，同時遇害的還有覺的保鏢以及幾名無辜市民。父母雙雙遇害而作為幸存者并且目擊了黑衣人真實容顏的少女久遠望（谷村美月 飾）便成為對方追殺的目標。為了保護小望，未詳同仁通力合作，并持續追索黑衣人的真面目以及其背后的陰謀。在此期間，當麻也展示了其不為人知的SPEC。一場斗智斗勇的戰斗拉開了序幕……

 從未失手的珠寶大盜，本想干完最后一票便金盆洗手，卻與中年失意的精英高管意外結盟，聯手布下棋局。另一邊，深陷職場困局的王牌警探，正憑借蛛絲馬跡一步步將矛頭對準他們，更有黑幫劫匪暗中蟄伏，伺機攪局。螳螂捕蟬、黃雀在后，當規則與道德的邊界被打破，這場顛覆命運的驚天罪案，究竟誰能安全脫身？

　　自幼能夠看到恐怖幽靈的八神森司（中山優馬 飾），在高中時邂逅了被神秘鬼影糾纏的后輩小歷（島崎遙香 飾）。他雖然喜歡對方，卻由于自身膽怯的性格始終無法表白。第一年沒有考上大學，經過一番努力森司如愿進入期望的高校，并且和小歷重逢。在此期間，他聽說小歷和童年好友加入了某個超自然研究會，聯想到高中的事件，森司無法對小歷放任不管，于是也硬著頭皮加入進去。這群個性滿滿的年輕人每天追蹤各類神秘事件，不久后校園內開始出現離奇現象，而小歷也成為惡靈狙擊的目標……　　本片根據第19屆日本恐怖小說大獎讀者獎獲得者櫛木理宇的同名作品改編。