以成為神奇寶貝大師為目標，小智（松本梨香 配音）、小剛（うえだゆうじ 配音）和小光（豊口めぐみ 配音）帶著各自的神奇寶貝在世界各地進行艱苦的修業之旅，今天他們歷經長途跋涉終于來到了風景秀美的米琪亞鎮。在當地一對小兄妹的介紹下，小智一行前往神殿遺址游玩。誰知卻遭遇了極其危險的情況。關鍵時刻，掌管時間的迪亞魯加和守衛神殿的西娜（北乃きい 配音）、凱賓（岸祐二 配音）幫助了他們，能與神奇寶貝心靈溝通的西娜還熄滅了冥王龍的怒火。從西娜口中得知，創造了世界的神奇寶貝即將蘇醒，它不僅會使時空扭曲錯亂，還將為世界帶來毀滅性的災難…… 本片為神奇寶貝系列第十二部電影劇場版。

　　寂靜深夜，Selly（Violenzia Jeanette 飾）、Jack（Ricky Harun 飾）、Tando（Zidni Adam 飾）三名喜好刺激的青年男女駕駛機車飛馳在公路上，突然之間，Selly的機車失控，她摔倒在地，身受重傷，昏迷不醒，Jack、Tando連忙將其送往醫院。與此同時，來自日本的女孩幸子（蒼井空 飾）正準備和當地的導游外出游玩，誰知卻不小心用車門夾上導游的手，語言本就不同的二人也慌慌張張前往醫院。不久之后，兩組人馬在這間有些陰森的醫院內會合，隱隱約約中，一個留著長發卻看不清面容的女人不時逡巡在幸子等人的周圍。　　對于這幾個有些倒霉的青年來說，恐怖而又爆笑的夜晚正慢慢拉開序幕……

 在系列終章中，幸存者們將面對蒙面陌生人的新威脅。隨著秘密浮出水面，現實與危險的界限逐漸模糊，他們的生存之戰也愈發兇險。

　　民國年間，上海灘閘北區保德路發生一樁命案，死者后來經過確認，竟然是馬源商會老板馬廣則。　　多年來，馬源商會在閘北一直都頗具影響力，馬廣則更是最被看好的商界風云人物，他的死打破了閘北區原本的寧靜。