經過長時間的休整，治療眼傷的瀨文焚流（加瀨亮 飾）終于隨著當麻（戶田惠梨香 飾）重返闊別已久的未詳，只是此時來自公安部公安五課的市柳（でんでん 飾）和吉川（北村一輝 飾）握得實權，令瀨文等人頗為氣悶。與此同時，在市井算命的覺被一掌握瞬間移動能力的黑衣男子射殺，同時遇害的還有覺的保鏢以及幾名無辜市民。父母雙雙遇害而作為幸存者并且目擊了黑衣人真實容顏的少女久遠望（谷村美月 飾）便成為對方追殺的目標。為了保護小望，未詳同仁通力合作，并持續追索黑衣人的真面目以及其背后的陰謀。在此期間，當麻也展示了其不為人知的SPEC。一場斗智斗勇的戰斗拉開了序幕……

當一位作曲家的任務是完成她已故導師的協奏曲時，她很快發現演奏音樂會帶來致命的后果，這讓她發現了旋律的令人不安的起源和已經覺醒的邪惡。

　　廣告界名模戴李察原為名噪一時之大盜“一棚牙”，后因厭倦江湖，與舊拍檔阿蕊互相協議金盆洗手，而阿蕊亦轉而從良，下嫁刑事偵緝警官吳超人。察有一世侄志偉，欲得盜竊的真傳衣缽，但為所拒，無奈志偉卻不罷休。另一方面，指揮官胡處長安排超人及當紅干探沖鋒車，以一顆幾可亂真之寶石，由沖鋒車以歸僑身份，擺設酒會，實行布下香餌釣金鰲。當沖鋒車公開展示寶石之際，志偉果然心癢難忍，在混亂中，將寶石盜取。沖鋒車奪回寶石...